好医保旗舰版和6年版各有其优势，具体哪个更好取决于您的个人需求和偏好。

好医保旗舰版是一款保障全面的长期百万医疗险产品，最高保额达到400万，并且将疾病保障分为“14种特定疾病（癌症及心脑血管病）”和“其它疾病”两大类，各自能报销400万。此外，旗舰版还提供了包括质子重离子放疗、特药服务、重疾绿通等多项增值服务，保障内容非常丰富。同时，旗舰版保证续保20年，续保条件相对较好。

而好医保6年版则具有6年保证续保的特点，并且在免赔额方面有一定优惠，确诊重疾时还能获得1万元的重疾津贴。此外，6年版也涵盖了住院垫付、就医绿通等增值服务，但可能缺少一些旗舰版的特色保障，如质子重离子放疗等。不过，6年版的价格可能相对更为亲民，适合对价格有一定考量的消费者。

综合来看，如果您希望获得更全面的保障和更多的增值服务，且对价格不是特别敏感，那么好医保旗舰版可能更适合您。而如果您更看重续保条件和价格因素，那么好医保6年版也是一个不错的选择。

需要注意的是，保险产品的选择应根据个人的实际情况和需求进行，建议您在购买前仔细阅读保险条款和说明，了解产品的保障范围、免赔额、续保条件等重要信息，以便做出明智的决策。