如果在广西交的新农合，但在新会中医院住院，可以报销医疗费用。

一般来说，新农合异地住院需要办理异地备案手续，如果已经办理了异地备案手续，那么在出院时可以直接在医院大厅的人工医保报销窗口进行直接报销。如果没有办理异地备案，那么在出院后需要携带相关资料回参保地进行报销。

需要注意的是，不同地区的报销比例可能存在差异，建议提前咨询参保地与就医地医保部门，了解更多关于异地就医的信息。