身份证上的芯片可能会受到电磁干扰的影响，导致读取不成功。因此，在使用身份证进行扫描或读取时，建议将身份证单独取出，避免与手机或其他电子设备一同放置在一起。如果必须要将身份证和手机放在一起，最好将身份证放在手机屏幕的反面，可以减少电磁干扰的影响。

总之，将手机和身份证放在一起并不会直接损坏身份证，但可能会对身份证芯片的读取产生一定的影响，因此在必要时需要注意它们的安放位置。