MC和MS在多个方面存在差异：

含义：MC是英文缩写，代表多个含义，包括边际成本、主控、磁卡等。而MS的含义也相对较多，包括毫克、毫升、女士等。

单位：MC一般不是一种单位，而MS表示的是质量单位，1克等于1000毫克（mg）。

药物名称：MC可以作为某些药物的名称缩写，如米非司酮等。而MS通常不直接表示为药物名称。

缩写词的拼写：MC的常见拼写方式有Mac、Mc等，而MS的常见拼写方式为Ms。

综上所述，MC和MS在含义、单位、药物名称以及缩写词的拼写等方面存在显著差异。如需更多信息，建议根据具体使用场景进一步判断。