农村营运客车不按线路营运，应及时向当地公安交警部门反映情况，拨打12345交通违法举报电话，或前往就近的公安交警部门进行投诉。

如发现该客车存在违规营运的情况，公安交警部门将立即进行调查处理，并对营运客车进行查处，维护公共交通秩序和市场竞争环境。同时，建议农村旅客选择符合规定、按照线路等规定运营的客运车辆，确保出行安全、顺畅。