区别在主动权和赔偿方面。被迫辞职是指由于用人单位存在的违法情节，迫使劳动者辞职。这一类公司方面是要对员工进行赔偿的，而且自己也可以要求公司开离职证明，可以申请失业保险金。

而自动离职，是职工没有向公司提出离职申请或者离职时间没有到期而擅自离职。这一类是没有赔偿的，也可能会导致工资被扣取。