秦国没有吞并福建的原因主要有两个方面。首先，早在秦始皇统一六国时，秦军就已经进入福建，并设立了闽中郡。然而，由于福建复杂的地形和百越民族的杂居，秦朝对其的统治方式是“仍令其君长（指闽越王）治之”，这意味着秦朝并没有直接统治福建，而是保留了当地君主的权力。因此，从行政上来说，秦朝时期福建实际上并未纳入秦朝的管辖。

其次，福建在汉朝时期才正式纳入中央政府的管辖。直到汉武帝元鼎五年（前112年），闽越国发生叛乱，汉朝才将福建纳入会稽南部都尉管辖。这说明在秦朝之后，福建才逐渐被纳入中央政府的统治之下。

综上所述，秦国没有吞并福建的原因主要是福建复杂的地形和百越民族的杂居，以及秦朝对福建的特殊统治方式。这些因素导致秦朝时期福建并未纳入秦朝的管辖，而是在汉朝时期才被正式纳入中央政府的统治之下。