有限公司和商行是两种不同的企业组织形式，它们各有优缺点，选择哪种更好取决于企业的具体情况和经营者的需求。

有限公司是一个法律实体，股东的有限责任保护了他们的个人财产，公司债务不会影响股东的个人财产。有限公司的优点还包括公司治理结构规范，有利于长期发展。然而，有限公司的缺点是设立和运营的程序比较复杂，需要提交的资料较多，且需要专业的会计师和律师进行管理和法律咨询。

商行则是一种商业组织形式，通常规模较小，经营者与所有者是同一人。商行的优点是设立简单，运营灵活，可以快速做出决策。但是，商行的缺点是缺乏法律保护，如果商行破产，所有者的个人财产可能会受到损失。

因此，对于想要长期稳定发展的企业来说，有限公司可能是一个更好的选择。而对于小规模、家庭式经营的企业来说，商行可能更为适合。当然，这只是一般情况下的结论，具体选择还需根据企业的情况和经营者的需求进行评估。