在畅捷通T6系统中，修改凭证的步骤如下：

首先进入系统，选择“总账”模块，在“凭证查询”中筛选出需要修改的凭证。

选中需要修改的凭证后，点击“修改”按钮进入修改状态。

在修改状态下，根据需要修改凭证的内容，如摘要、科目、金额等，并保存修改。

修改完毕后，退出修改状态并保存。

如果需要打印修改后的凭证，可以点击“打印”按钮进行打印。

请注意，修改凭证应在保证数据准确性和完整性的前提下谨慎操作，建议在操作前进行必要的备份或记录。