是的，京东发货时间超过48小时会被罚款。

因为京东作为一个电商平台，其重要的服务之一就是快速发货，以满足顾客的需求和期望。

而超过48小时还未发货的情况，就意味着京东未能在承诺的时间内完成发货，可能会给顾客带来不便和不满。

因此，京东对于超时发货的商家，会给予一定的罚款作为惩罚。

值得注意的是，这个罚款制度也是可以改变的，因为企业运营的环境和政策等因素都会影响到其经营策略和市场行为。

因此，严谨的企业经营和有效的政策监管，都是保障消费者权益的重要因素之一。