如果公积金公司补缴后，自己的部分也需要跟着补缴，可以通过网上银行、手机银行、ATM机、柜台等渠道进行补缴。具体操作步骤包括：选择缴费类型为“个人补缴”或“个人补缴（补差）”，输入缴费金额和个人公积金账号，确认支付即可。需要注意的是，个人补缴的金额不能超过当月实际工资的50%。