如果四川农业大学的学位证书原件丢失了，可以采取以下步骤来补办：

1. 联系学校或院系：首先，应该立即联系所在的学校或院系，告知他们学位证书丢失的情况。学校或院系会告知具体的补办流程和要求。

2. 填写申请表格：通常，学校或院系会要求填写一份申请表格，用于补办学位证书。在填写表格时，需要提供个人的基本信息、丢失证书的详细信息等。

3. 提供相关证明文件：为了证明身份和学历，需要提供相关的证明文件，如身份证、学生证、成绩单等。这些文件可以帮助学校或院系核实个人信息和学历情况。

4. 缴纳费用：根据学校或院系的要求，可能需要缴纳一定的费用用于补办学位证书。费用的具体金额和缴纳方式可以在学校或院系的通知中找到。

5. 等待补办完成：提交申请和相关证明文件后，需要等待学校或院系审核并补办学位证书。通常情况下，补办过程需要一定的时间，具体时间因学校或院系而异。

需要注意的是，不同学校或院系的补办流程和要求可能有所不同，因此最好先联系学校或院系了解具体的补办流程和要求。另外，为了避免类似情况再次发生，建议妥善保管好个人的证书和证明文件。