大汶河的主要污染源包括沿河两岸的城市、工业污废水的排放及农业生产中的农药、化肥的施放。为改善水质，采取了多种治理措施，如底泥清理、河床修复、污水治理、生态重建等。这些措施旨在减少污染、提升水环境，并通过湿地生态修复、建设生态隔离带等有效补充地下水。