华科的启明实验班与本硕博在多个方面存在显著的差别。启明实验班作为一种特殊的教育模式，注重小班化教学、专业导师制以及创新性试验计划的实施，旨在通过国内外知名院士、教授等优秀师资的引导，培养学生自主创新研究与实践的能力。

而本硕博则是一种连贯的高等教育阶段，涵盖了本科、硕士和博士的学习，主要针对具备天赋和才华的学生，希望他们尽早完成高等教育并在工作或研究中有更广阔的发展。

两者在培养目标、教学方式以及学历层次上都有明显的不同。