总工程款的百分之五通常是指在签订合同之后，承包商需要支付给业主的保证金金额。这个保证金通常是工程款的百分之五，也可以根据合同约定进行调整。保证金的目的是为了确保承包商能够按照合同要求按时完成工程，并且保证质量达到标准。

一般情况下，当工程完工并经过验收合格后，保证金会在一定的时间内返还给承包商。

如果承包商没有按照合同的要求完成工程或者存在其他违约行为，业主可以使用保证金来弥补损失。