吡丙醚的卫生证和农业证主要区别在于其使用范围和目的。卫生证主要关注吡丙醚在公共卫生、家庭环境等领域的使用安全，确保其对人类健康无害。而农业证则关注吡丙醚在农业生产中的应用，如防治农作物病虫害，确保农作物的产量和质量。

两者都需经过严格的测试和审批，以确保产品的安全性和有效性。