农村医保断交的影响，具体如下：

1、影响农民住院报销，如果不断缴，农民生病住院只要达到了报销标准就会给报销一定比例的医药费，如果断缴了就失去了这方面的权利；

2、买药要自费。交了新农合农民就可以使用保障卡到药店买药，如果断缴，保障卡就失效了，农民买药只能自费；

3、会影响后续新农合的上缴。如果年年上缴，新农合方面就会有个良好的记录，而如果中间断缴了，后续想续交就会比较麻烦，可能需要相关的证明。相应的办理程序：

（1）本人申请并积极缴纳合作医疗款；

（2）村委会审核并向镇合管站提交筹资花名册、筹资票据；

（3）镇合疗办复查，审核合疗筹资表，向县合疗中心提出申请签证；

（4）县合疗经办中心审核无误后，办理签证、盖章、登录，确认。