广州白云区境内主要河流有流溪河和珠江，其中流溪河是白云区最大的河。

流溪河，珠江水系北江支流。主源出从化区吕田镇与新丰县交界处，在从化区东北与龙门县交界处汇入增江。全长 156 公里，流域面积 2300 平方公里。流溪河在白云区的主要支流有白坭河、石井河、新市涌等。