根据《中华人民共和国民事诉讼法》第四十九条规定，当事人可以自行选择向人民法院起诉，但是如果涉及到仲裁条款的约定，则应先经过仲裁机构裁决或者仲裁裁决书生效后再向人民法院起诉。

因此，即使仲裁金额不超过3万，如果涉及到仲裁条款的约定，公司仍需要先通过仲裁机构解决争议，再考虑是否向人民法院起诉。